molecular biology Arbeiten

Co-option of a mouse-specific retrotransposon rewires Ash2l isoform usage to prime developmental promoters

Die Studie zeigt, dass die Ko-optierung eines mausspezifischen Retrotransposons die Nutzung von Ash2l-Isoformen während der Differenzierung steuert, indem es über Transkriptionsinterferenz eine Stammzell-spezifische, verkürzte Isoform erzeugt, die Entwicklungs-promotoren für die H3K4-Methylierung vorbereitet und somit die Embryonalentwicklung sowie die Differenzierung motorischer Neuronen ermöglicht.

Elgood Hunt, E., Vivori, C., Mitter, R. + 9 more2026-02-26📄 molecular biology

Medulloblastoma-associated mutations in the RNA helicase DDX3X/DED1 cause defects in the translational response to TORC1 inhibition

Die Studie zeigt, dass medulloblastomassoziierte Mutationen im RNA-Helikase DDX3X/DED1 die zelluläre Antwort auf TORC1-Inhibition stören, indem sie die selektive Translation von wachstumsfördernden, unstrukturierten mRNAs aufrechterhalten und so das Tumorwachstum trotz Stresssignale fördern.

Swarup, A., Kuhs, R. A., Hardman, V. U. + 3 more2026-02-26📄 molecular biology

Summarizing RNA Structural Ensembles via Maximum Agreement Secondary Structures

Die Autoren stellen das NP-schwere MASS-Problem vor, das durch die Suche nach einer maximalen Menge struktureller Merkmale, die eine RNA-Strukturkollektion in vorgegebene Cluster unterteilt, eine neue Methode zur gleichzeitigen Gruppierung und Identifizierung konsensueller Motive in RNA-Sekundärstrukturen bietet.

Gu, X., Ivanovic, S., Feng, D. W. + 1 more2026-02-26📄 molecular biology

Dynamic engagement of dual-role regulators by the Sin3 complex

Diese Studie nutzt einen integrativen strukturellen Ansatz, um zu zeigen, wie der dual-funktionelle Chromatin-Leser Cti6 und die Transkriptionsfaktoren Ash1 und Ume6 dynamisch mit dem Sin3-Komplex interagieren, wodurch molekulare Mechanismen für die Verknüpfung von Genrepression und -aktivierung aufgeklärt werden.

Olivet, J., Shewakramani, N. R., Cesare, J. + 22 more2026-02-26📄 molecular biology

Identifying severe COVID-19 risk variants modulating enhancer reporter activity in lung cells

In dieser Studie wurden über 4800 mit schwerem COVID-19 assoziierte genetische Varianten in Lungenepithelzellen mittels eines hochparallelen Reporterassays und Deep-Learning-Modelle analysiert, um 29 allelspezifisch die regulatorische Aktivität modulierende Varianten sowie potenzielle Zielgene und Transkriptionsfaktoren zu identifizieren.

Weykopf, G., Bickmore, W. A., Biddie, S. C. + 1 more2026-02-26📄 molecular biology

End-to-end single-stranded DNA sequence design with all-atom structure reconstruction

Die Studie stellt InvDNA vor, ein tiefes Lernverfahren, das End-to-End-Sequenzdesign für einzelsträngige DNA ermöglicht und dabei durch direkte Nutzung von Rückgrat-Koordinaten sowie eine überlegene Sequenzwiederherstellung und Faltungsfähigkeit bestehende Methoden deutlich verbessert.

Si, Y., Xu, Y., Chen, L.2026-02-25📄 molecular biology

A non-canonical role of Myc in programming basal cells as sentinels of upper airway immunity during influenza infection

Die Studie zeigt, dass Myc in basalen Zellen der oberen Atemwege nicht nur für die mukosale Regeneration nach Influenza-Infektionen essenziell ist, sondern diese Zellen auch als spezialisierte Wächter fungieren, die durch einen MYC-abhängigen CXCL10-CXCR3-Signalweg zytotoxische CD8+ NKT-Zellen rekrutieren, um die akute Reparatur zu orchestrieren.

Foote, A. G., Sun, X.2026-02-25📄 molecular biology

Inferring Accumulation Times of Mitochondrial DNA Deletion Mutants from Cross-Sectional Single-Cell Data: Application to Tabula Muris Senis

Die Studie wendet ein stochastisches Modell auf Einzelzell-RNA-Sequenzierungsdaten des Tabula Muris Senis-Projekts an, um nachzuweisen, dass mitochondriale Deletionsmutanten in Muskelzellen durch seltene Mutationen und eine rasche klonale Expansion innerhalb von etwa drei Monaten bis zur Dominanz anwachsen, wobei spezifische Gen-Deletionsmuster wie ND5/ND6-Hotspots und ATP6-Effekte auf selektive Vorteile hinweisen.

Kowald, A., Kirkwood, T. B. L.2026-02-25📄 molecular biology

Molecular characterization of chikungunya viruses associated with outbreaks in Kenya from 2017 to 2020

Diese Studie charakterisiert molekular und phylogenetisch die zwischen 2017 und 2020 in Mombasa und Dadaab-Hagadera in Kenia auftretenden Chikungunya-Virusausbrüche der indischen Ozean-Linie, identifiziert spezifische Mutationen, die die Vektoranpassung fördern, und hebt klinische Symptome wie Muskelschmerzen und Kopfschmerzen als wichtige Unterscheidungsmerkmale gegenüber anderen akuten fieberhaften Erkrankungen hervor.

Ochieng, D. A., Juma, B., Muriuki, J. + 12 more2026-02-25📄 molecular biology

An Alport variant illuminates the bioactivity of the collagen IV α565- α121 scaffold in Bowman's capsule.

Diese Studie zeigt, dass die Verschiebung einer spezifischen Z-Anhängsel-Mutation vom α3- auf das α5-Kollagen-IV-Subunit bei Alport-Syndrom-Mäusen nicht zu Glomerulopathie führt, sondern eine bisher unbekannte bioaktive Rolle des α5α6-α1α2-Scaffolds in der Bowman-Kapsel aufdeckt, deren strukturelle Störung zu einer pathologischen Verdickung dieser Kapsel führt.

Pokidysheva, E., Koirala, R., Clarke, B. + 3 more2026-02-25📄 molecular biology

Annexin A2 Regulates Surfactant Dysfunction During Injurious Ventilation.

Die Studie zeigt, dass das Protein Annexin A2 die Funktion des Lungenoberflächenaktiven Stoffes während einer schädlichen Beatmung reguliert, indem es den Gehalt an POPG und die Oberflächenspannung aufrechterhält, was es zu einem potenziellen therapeutischen Ziel für ARDS-Patienten macht.

Bentley, I. D., Fritz, J., Kapoor, A. + 3 more2026-02-25📄 molecular biology

Dosage compensation defects due to roX RNA deletion are rescued by recalibration of X/autosome stoichiometry

Die Studie zeigt, dass der Verlust der roX-RNA in männlichen Drosophila-Zellen zu einem Defekt in der Dosiskompensation führt, der jedoch durch eine schnelle evolutionäre Anpassung kompensiert wird, bei der zusätzliche X-Chromosomen erworben werden, um das Verhältnis von X-Chromosomen zu Autosomen wiederherzustellen.

Gkountromichos, F., Yankson, G., Jayakrishnan, M. + 4 more2026-02-25📄 molecular biology

Circadian immunometabolic states impart a temporal response to SARS-CoV-2 spike proteins in mammalian macrophages

Die Studie zeigt, dass die circadiane Uhr in Säugetier-Makrophagen durch zentrale metabolische und mitochondriale Veränderungen steuert, wie und wann diese Zellen auf SARS-CoV-Spike-Proteine reagieren, wobei die Tageszeit der Exposition zu entweder immunsuppressiven oder schwach aktivierenden Zuständen führt.

Buel, S. M., Balaraman, J., Jankowski, M. S. + 10 more2026-02-25📄 molecular biology

Exposure to per- and polyfluoroalkyl substances elicits cell type-specific impacts on p53 and TGF-β signaling pathways

Die Studie zeigt, dass die PFAS-Verbindungen PFOA und GenX zelltypspezifische toxische Wirkungen entfalten, wobei GenX weniger zytotoxisch ist als PFOA, beide jedoch in menschlichen Haut-, Leber-, Nieren- und Darmzelllinien Entzündungswege über TGF-β/SMAD aktivieren und eine DNA-Schadensantwort über p53 auslösen.

Ding, H., Slack, M., McClure, H. + 6 more2026-02-24📄 molecular biology

Single-Cell and Spatial Methods for Multimodal Functional Glycan Profiling in Tissues

Die Studie stellt zwei neue Plattformen, scGOAT-seq und GlycoScope, vor, die mithilfe menschlicher Lektine funktionelle Glykan-Zugänglichkeit in Einzelzell- und räumlichen Multiomik-Daten integrieren, um damit bisher unentdeckte glykanbasierte Immunaktivierungszustände und räumliche Glykanprogramme in Tumormikroumgebungen aufzulösen.

Basak, A., Ortiz-Cordero, C., Yiu, S. P. T. + 27 more2026-02-24📄 molecular biology

Developmentally Regulated GTP-binding Protein Drg1 defines a translational decision point that protects mitochondrial integrity

Die Studie zeigt, dass das evolutionär konservierte GTPase-Protein Drg1 die Translation mitochondrieller Proteine an der äußeren Mitochondrienmembran steuert und dadurch entscheidend zur Aufrechterhaltung der mitochondrialen Morphologie, Dynamik und Funktion beiträgt.

Saha, S., Jin, H.2026-02-24📄 molecular biology

Oncogenic chromodomain mutations allosterically impair TIP60 acetyltransfearse function preventing activation of DNA repair genes under genotoxic stress

Die Studie zeigt, dass onkogene Mutationen im Chromodomain von TIP60 allosterisch dessen trimerische Struktur destabilisieren und die Acetyl-CoA-Bindung sowie die Histonacetyltransferase-Aktivität beeinträchtigen, was trotz intakter Chromatinbindung zu einem Ausfall der DNA-Reparatur und genomischer Instabilität führt.

Gupta, H., Bansal, A., Gupta, A.2026-02-24📄 molecular biology

Proteomic Signatures of Mitochondrial Dysfunction Associated with Atrial Fibrillation in Goats

Diese Studie identifiziert mittels proteomischer Analysen von Vorhofgewebe Ziegen eine koordinierte mitochondriale Dysfunktion bei Vorhofflimmern, bei der das Hitzeschockprotein HSPA9 als zentraler Regulator der Störung der Komplexe I und III der oxidativen Phosphorylierung fungiert.

Ayagama, T., Barrett-Jolley, R., Fischer, R. + 4 more2026-02-24📄 molecular biology

Selective targeting of a histone-like silencer Sfx to the R6K conjugal transfer operon

Diese Studie zeigt, dass das Plasmid R6K seinen eigenen H-NS-Homologen Sfx nutzt, um durch kooperative Bindung an den Rho-Faktor und Phasenseparation spezifisch das Konjugationsoperon *vir* zu unterdrücken, wodurch ein regulatorisches Nischen-Modell etabliert wird, das die genomische Partitionierung durch histonähnliche Proteine erklärt.

Wang, B., Gupta, R., Blaine, N. + 6 more2026-02-24📄 molecular biology

Testing vivo-morpholino mediated gene knockdown in threespine stickleback

Die Studie zeigt, dass die intraperitoneale Injektion von vivo-Morpholinos zwar eine gezielte Gen-Knockdown-Methode in adulten Dornbarschen darstellt und erfolgreich für das Gen Spi1b nachgewiesen wurde, jedoch eine Optimierung der Verabreichungsmethoden notwendig ist, um die bisher variable Effizienz und Reproduzierbarkeit zu verbessern.

DiPippo, S. M., Monzon, A. R., Bolnick, D. I. + 1 more2026-02-24📄 molecular biology

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